278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4964 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 275 aa  553  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  57.78 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  57.78 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  57.68 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  54.77 
 
 		 286 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  55.38 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  55.38 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  56.15 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  54.06 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  55.08 
 
 		 277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  53.12 
 
 		 390 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  53.12 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  52.73 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  52.34 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  52.24 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  52.94 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  36.43 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  37.23 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  31.8 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  33.48 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  33.91 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  35.04 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  31.89 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  31.78 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  24.73 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  26.36 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  25.94 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.03 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  25.23 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  28.26 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  27.92 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.1 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.12 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.91 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  24.42 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  31.94 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 387 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>