More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6254 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  59.47 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  59.77 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  56.06 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  55.3 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  56.06 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  54.92 
 
 		 271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  44.81 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  47.24 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  45.15 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.09 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.16 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  28.01 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  28.3 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.07 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.21 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.4 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.21 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.21 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  26.77 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  24.57 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  27.24 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.89 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  25.61 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.18 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.45 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  25 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  25 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  28.04 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>