193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0088 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  68.32 
 
 		 272 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  64.91 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  65.77 
 
 		 271 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  66.67 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  64.48 
 
 		 280 aa  349  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  58.27 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  56.63 
 
 		 284 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  54.58 
 
 		 287 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  51.98 
 
 		 282 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  51.18 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  50.43 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.28 
 
 		 270 aa  201  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  44.58 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  42.17 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  44.49 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  43.7 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  41.95 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  39.92 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  36.09 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  36.03 
 
 		 390 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  36.44 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  36.44 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  38.89 
 
 		 176 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  33.73 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  20 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.97 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  28.92 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  37.1 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  22.57 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  23.18 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.15 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  24.36 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.59 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.59 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.07 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.07 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 327 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  23.31 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  20.79 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  21.88 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.88 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  34.48 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  20.58 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>