More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0806 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  91.04 
 
 
279 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  55.91 
 
 
278 aa  328  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 
277 aa  296  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 
278 aa  224  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 
284 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 
273 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  41.6 
 
 
310 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
259 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
275 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
405 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.65 
 
 
370 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.15 
 
 
370 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
350 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.45 
 
 
372 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.82 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.94 
 
 
370 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
361 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.88 
 
 
462 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 
261 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.72 
 
 
370 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.74 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.31 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
246 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
278 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.36 
 
 
368 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
296 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.88 
 
 
562 aa  85.9  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.37 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.74 
 
 
368 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.41 
 
 
370 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.2 
 
 
341 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  24.54 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.96 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 
453 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  24.42 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  24.81 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25.09 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.95 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.77 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  25.8 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  23.4 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.87 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  36.44 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25.18 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  21.55 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>