More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2307 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  58.94 
 
 		 283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.4 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.67 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.34 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 237 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  28.28 
 
 		 264 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.51 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.18 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  31.14 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.75 
 
 		 425 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.32 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.57 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  31.09 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  30.23 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.06 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  30.83 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.07 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.64 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.07 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.69 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.08 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.63 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.09 
 
 		 368 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.67 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  29.35 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.88 
 
 		 368 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.21 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>