More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0843 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  62.64 
 
 		 273 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  53.21 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  51.32 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  35.58 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3732  Alpha/beta hydrolase fold-1  46.59 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  32.47 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  30.38 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  31.27 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  30.74 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  31.78 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  34.11 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 303 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  30.86 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  33.33 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.73 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.67 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  33.85 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  32.36 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  30.86 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  28.19 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  28.85 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.27 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  31.64 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  29.75 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.75 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  29.75 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  30.43 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  29.75 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  28.46 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  28.46 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  28.46 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  30.92 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  28.63 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  29.76 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  31.4 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  32.18 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  29.39 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  29.44 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  29.44 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  29.44 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  29.44 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.3 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  29.17 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  29.44 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  31.01 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.45 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>