More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3758 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
370 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  79.4 
 
 
370 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.69 
 
 
370 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.76 
 
 
371 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.49 
 
 
371 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.49 
 
 
371 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  75.14 
 
 
371 aa  557  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  75.41 
 
 
371 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  74.59 
 
 
371 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  74.32 
 
 
371 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.38 
 
 
370 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.65 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  56.28 
 
 
370 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.74 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.92 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.92 
 
 
368 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.46 
 
 
374 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.59 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.59 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.61 
 
 
380 aa  332  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.7 
 
 
372 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
372 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.25 
 
 
370 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.03 
 
 
371 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.52 
 
 
389 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.8 
 
 
443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.41 
 
 
440 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.05 
 
 
398 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.6 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
290 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
277 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
311 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
309 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.7 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  51.72 
 
 
450 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  47.54 
 
 
450 aa  96.3  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
284 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
290 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.31 
 
 
99 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
274 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
279 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.38 
 
 
437 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
288 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
288 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
246 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
256 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  30.88 
 
 
286 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
288 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
312 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
287 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
299 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
299 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
299 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
271 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.14 
 
 
288 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
295 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.3 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.78 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
266 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  29.84 
 
 
258 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.92 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
260 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>