More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1981 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  81.82 
 
 		 288 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  77.27 
 
 		 289 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  76.06 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  76.33 
 
 		 289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  76.41 
 
 		 288 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  74.02 
 
 		 289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  72.4 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  72.4 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  71.99 
 
 		 288 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  71.23 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  72.4 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  72.4 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  72.4 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  71.23 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  70.88 
 
 		 288 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  55.28 
 
 		 286 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  54.23 
 
 		 286 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 		 294 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  41.2 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  36.47 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  35.58 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  34.94 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.25 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.59 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.22 
 
 		 370 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.22 
 
 		 370 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.73 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.82 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.82 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.15 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.73 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>