More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0033 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  547  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.13 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  39.01 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  40.29 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  37.15 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2815  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.07 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0170711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  33.94 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 273 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.59 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  32.98 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.82 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.49 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  30.28 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.65 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 350 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.48 
 
 		 368 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.71 
 
 		 370 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.44 
 
 		 370 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  29.59 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.97 
 
 		 371 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.97 
 
 		 371 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.04 
 
 		 370 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.75 
 
 		 368 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>