More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2047 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
312 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  35.77 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  35.77 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 
311 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
311 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
311 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
292 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.28 
 
 
275 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
339 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.37 
 
 
313 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
296 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.37 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.97 
 
 
370 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
316 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
346 aa  95.9  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.3 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 
370 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  29.59 
 
 
270 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  30.08 
 
 
270 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  29.59 
 
 
270 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.17 
 
 
374 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  24.83 
 
 
289 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
291 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.35 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
314 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.63 
 
 
371 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.15 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.84 
 
 
370 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.95 
 
 
370 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
268 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.56 
 
 
370 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  29.21 
 
 
270 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3646  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
136 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
278 aa  85.9  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.29 
 
 
371 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.79 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
287 aa  85.9  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  28.84 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.36 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  28.84 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.96 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.96 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  24.75 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.17 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.25 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.59 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.31 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.27 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  22.27 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.79 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.27 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.27 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>