More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3452 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
311 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  41.3 
 
 
315 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  41.3 
 
 
315 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 
309 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
312 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
292 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
311 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
311 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.77 
 
 
275 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
339 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
346 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
296 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
312 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
323 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
277 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
339 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 
370 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
329 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
312 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
269 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.48 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
371 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.52 
 
 
371 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
344 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.82 
 
 
278 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
284 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  23.33 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  24.03 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  24.03 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.03 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
504 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.26 
 
 
370 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  23.13 
 
 
290 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.17 
 
 
367 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
311 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.16 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.26 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.73 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.04 
 
 
343 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  22.49 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
437 aa  86.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
258 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  22.58 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.47 
 
 
369 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.9 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
290 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.31 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.74 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  26.19 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3646  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.88 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  21.29 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  22.62 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>