More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0273 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  53.88 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  53.88 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 275 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 350 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  28.3 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.38 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  25.38 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 280 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.66 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.67 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  24.53 
 
 		 273 aa  85.1  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 340 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 267 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 340 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 340 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  25 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.3 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.6 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.6 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.1 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  21.82 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  24.25 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  24.6 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  24.44 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.6 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.19 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  23.38 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  23.38 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  27.1 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  27.1 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>