More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2092 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  43.7 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
271 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 
266 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  45.19 
 
 
273 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 
271 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  37.45 
 
 
266 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  45.11 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 
271 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  32.06 
 
 
263 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  34.25 
 
 
255 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3732  Alpha/beta hydrolase fold-1  45.49 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.75 
 
 
276 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  29.55 
 
 
261 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  32.08 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  29.77 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
278 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  31.7 
 
 
256 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  31.7 
 
 
256 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  31.7 
 
 
256 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  31.7 
 
 
256 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  31.7 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  31.7 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  31.7 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  30.94 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.21 
 
 
272 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
297 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
272 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
272 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 
281 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.3 
 
 
272 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
277 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  31.66 
 
 
264 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
269 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
272 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
273 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  29.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
281 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  31.03 
 
 
261 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
273 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
265 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  30.04 
 
 
255 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
279 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
273 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
266 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
286 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
266 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  30.68 
 
 
258 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  30.68 
 
 
258 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  30.68 
 
 
258 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  28.52 
 
 
278 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  29.28 
 
 
255 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
305 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  30.65 
 
 
270 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  28.35 
 
 
239 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  27.04 
 
 
280 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
273 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
273 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
279 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 
266 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
272 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
276 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  35.47 
 
 
254 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  28.74 
 
 
254 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  30.83 
 
 
275 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  35.47 
 
 
254 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  31.03 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
271 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  31.56 
 
 
274 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
286 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
274 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
263 aa  99  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  32.17 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  29.57 
 
 
266 aa  98.6  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  28.3 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  28.3 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  28.3 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  26.77 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  28.3 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
328 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  29.39 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  29.5 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>