More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2172 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  99.41 
 
 
340 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
340 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
340 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  83.82 
 
 
340 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  78.3 
 
 
341 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  83.53 
 
 
340 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  60.17 
 
 
350 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 
350 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  56.94 
 
 
309 aa  329  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  56.08 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 
314 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  52.68 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  54.61 
 
 
301 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  50.79 
 
 
322 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 
291 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 
291 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 
291 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  45.55 
 
 
290 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
295 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
287 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
291 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
298 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
275 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
284 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
286 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
283 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
271 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
271 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
339 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
276 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
281 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
284 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
345 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.21 
 
 
291 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.21 
 
 
290 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
308 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
288 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.84 
 
 
290 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
504 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.97 
 
 
275 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.47 
 
 
291 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  26.47 
 
 
291 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
266 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.07 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
264 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
257 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.85 
 
 
372 aa  96.3  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
286 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
260 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.84 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
275 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
284 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.1 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 
294 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 
294 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  26.59 
 
 
294 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.97 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
287 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
300 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
240 aa  93.2  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
264 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 
265 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
294 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
284 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
267 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
283 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.23 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  26.2 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  43.59 
 
 
290 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
283 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>