More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0193 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  69.47 
 
 
262 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  70.61 
 
 
262 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 
279 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  39.84 
 
 
279 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
279 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  39.62 
 
 
265 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  35.91 
 
 
282 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  37.5 
 
 
265 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 
282 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 
263 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.13 
 
 
261 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  37.07 
 
 
260 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.07 
 
 
260 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.35 
 
 
261 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  43.32 
 
 
393 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  37.89 
 
 
261 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  40.93 
 
 
393 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  37.74 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  37.35 
 
 
360 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  37.74 
 
 
261 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  38.13 
 
 
377 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  35.14 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  39.45 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  37.34 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  35.8 
 
 
260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 
263 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  34.36 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.7 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  35.14 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  39.06 
 
 
256 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  39.06 
 
 
256 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 
263 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  34.75 
 
 
260 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
259 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  36.19 
 
 
264 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  36.48 
 
 
270 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  38.82 
 
 
425 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  36.48 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  34.75 
 
 
258 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 
256 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  35.89 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  35.97 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
254 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  36.76 
 
 
263 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
373 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  35.95 
 
 
270 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  36.55 
 
 
260 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  36.03 
 
 
260 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 
263 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 
261 aa  158  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  34.48 
 
 
267 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  34.48 
 
 
260 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 
254 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 
262 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  35.18 
 
 
263 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  38.26 
 
 
261 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 
263 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  37.6 
 
 
263 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  32.42 
 
 
269 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 
264 aa  151  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 
256 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  36.11 
 
 
262 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  32.42 
 
 
275 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  35.56 
 
 
396 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  36.8 
 
 
386 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 
268 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  34.17 
 
 
263 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
396 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
258 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 
263 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  36.15 
 
 
266 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  35.43 
 
 
265 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
392 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  36.76 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  35.38 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.74 
 
 
393 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.74 
 
 
393 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.74 
 
 
393 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.74 
 
 
393 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
397 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.74 
 
 
393 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.74 
 
 
393 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  32.41 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>