More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2290 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  71.54 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  69.02 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  56.35 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  52.78 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  52.78 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  52.78 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  52.78 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  52.78 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  52.78 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  53.78 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  52.38 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  54 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  51.98 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  52.38 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  51.59 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  49.4 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  49.4 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  49.4 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  49.4 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  51.2 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  49.16 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  50.2 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  45.6 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  45.6 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  45.6 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  46.25 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  47.43 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  45.35 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  46.53 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  46.53 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  46.53 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  48.09 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  44.4 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  46.4 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  46.96 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  44.53 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  46.4 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  40.16 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  45.34 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  46.56 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  41 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  41.94 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  46.12 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  45.19 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  46.12 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  38.8 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  40.33 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  37.25 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  38.93 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  37.7 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  32.69 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  36.8 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.14 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  31.6 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.17 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  31.2 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  36.4 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  34.52 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  33.73 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  38 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  38 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  32.27 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  35.04 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  34.35 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  30.83 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  33.76 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  33.48 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  32.17 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  29.6 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  26.86 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  26.86 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.84 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  31.74 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  33.33 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  37.1 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.09 
 
 		 558 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  29.31 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  29.31 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  29.71 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.87 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  24.35 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>