More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2674 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  100 
 
 
282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  90.07 
 
 
282 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  83.33 
 
 
277 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  78.01 
 
 
277 aa  417  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  71.99 
 
 
277 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  71.28 
 
 
277 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  73.86 
 
 
292 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  71.99 
 
 
277 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
275 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
269 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  41.84 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
275 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
280 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
259 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
277 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
272 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  33.86 
 
 
278 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 
281 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
281 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  31.69 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.51 
 
 
425 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 
282 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 
259 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  34.01 
 
 
249 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
281 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
270 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.43 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  33.47 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.12 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.42 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 
393 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 
263 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  32.41 
 
 
266 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  33.47 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.6 
 
 
262 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
267 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
260 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 
264 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
260 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 
260 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
256 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
254 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
265 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
256 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
256 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 
373 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 
264 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 
261 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
393 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
262 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.34 
 
 
263 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
263 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 
262 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
261 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.02 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.1 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  29.46 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  44.86 
 
 
340 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.71 
 
 
393 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  47.66 
 
 
361 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  29.64 
 
 
264 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>