More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0531 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
264 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  69.08 
 
 
261 aa  308  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  38.52 
 
 
393 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.73 
 
 
425 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.53 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  37.14 
 
 
266 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  37.2 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  40.54 
 
 
251 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  31.89 
 
 
277 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 
256 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 
256 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 
256 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
260 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
254 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  39.22 
 
 
391 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
279 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 
373 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
279 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 
263 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 
262 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 
389 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  34.57 
 
 
262 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
260 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  36.16 
 
 
273 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
282 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  34.16 
 
 
262 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
277 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  33.85 
 
 
263 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 
265 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
263 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  31.38 
 
 
264 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
277 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.94 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  29.3 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.23 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  32.23 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  35.5 
 
 
390 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.65 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  29.73 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.1 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.8 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
275 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
386 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 
265 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.02 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
259 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  29.48 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  27.43 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  27.71 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.91 
 
 
275 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.51 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.35 
 
 
400 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  34.63 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.48 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 
393 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
267 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
287 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
256 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
271 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.52 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>