More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0069 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  99.62 
 
 		 260 aa  494  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 260 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 		 262 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  34.02 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  31.08 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.73 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.59 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.74 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  31.92 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.34 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.34 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  28.41 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.77 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.81 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.79 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  34.42 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  30.58 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  27.67 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  31.09 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.8 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  27.66 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.98 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.98 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.98 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>