More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3781 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  69.42 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 273 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  68.71 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  65.34 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 		 269 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  64.98 
 
 		 269 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  58.12 
 
 		 270 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  55.6 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  51.81 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  48.55 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  48.75 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  50.9 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  50.54 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  45.29 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  45.62 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  43.8 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  41.03 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  38.98 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 262 aa  99  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.82 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.08 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.9 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 312 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.83 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.83 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  35.71 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.3 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.3 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.03 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.95 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.03 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.03 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.95 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.34 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.1 
 
 		 370 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.2 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5615  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 		 2762 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>