More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2211 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  553  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  39.56 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  36.67 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  27.84 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  26.55 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.48 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  38.53 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  27 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  26.44 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  35.26 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  31.89 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35.26 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.26 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.71 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.24 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.91 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.87 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.26 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.56 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  36.94 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.04 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.8 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.17 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  22.88 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>