More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5689 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  26.14 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  27.7 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  24.58 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.13 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  34.91 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.91 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.4 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.24 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  24.53 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  33.96 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  26.29 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  34.29 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.56 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  35.79 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  24.28 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  24.28 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.11 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  27.44 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  25.14 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  41.86 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  25.14 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.77 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2745  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.34 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000661115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  28.7 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  33.63 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  37.11 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  28.7 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  46.03 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  39.36 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.37 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 		 350 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>