More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0768 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  70.48 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  38.1 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  29.23 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.51 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  32.14 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  32.14 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  24.34 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  35.29 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  27.6 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  35.86 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  42.71 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.3 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  35.17 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  29.96 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 340 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  34.45 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.75 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.08 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  38.54 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  37.76 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  27.56 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  28.01 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  37.5 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  26.18 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  26.76 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  31.68 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  36.23 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>