More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2427 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  44.24 
 
 
270 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 
263 aa  165  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
266 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.71 
 
 
267 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  34.44 
 
 
267 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  27.48 
 
 
258 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
263 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  31.16 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  32.37 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
324 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
271 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
331 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
272 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
281 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
279 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.67 
 
 
272 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
324 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
271 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
286 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
292 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
266 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
273 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
273 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
274 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
277 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
273 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
277 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
279 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  30.22 
 
 
273 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
277 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
273 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  28.99 
 
 
273 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
273 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.02 
 
 
272 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
266 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
275 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  29.48 
 
 
312 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 
278 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
271 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.37 
 
 
265 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  28.98 
 
 
315 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
274 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
334 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  32.49 
 
 
326 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
326 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  32.49 
 
 
326 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  29.09 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  29.18 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.38 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  29.18 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  30.36 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  30.14 
 
 
412 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
330 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
276 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
274 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.94 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.67 
 
 
273 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  27.96 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  28.88 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  27.7 
 
 
277 aa  92  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
273 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
273 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  28.31 
 
 
278 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  28.31 
 
 
278 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.31 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
278 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.33 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  28.31 
 
 
278 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  28.31 
 
 
278 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>