233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3484 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  29.92 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  26.34 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.28 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.74 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3492  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000132504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3759  hydrolase, alpha/beta fold family  23.13 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000154361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  23.79 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.18 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.18 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  24.34 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.18 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  21.64 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 397 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  21.8 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  21.8 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  20.68 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2058  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  32.71 
 
 		 199 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  23.86 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  23.85 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3504  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  25.71 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  23.1 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  29.77 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  22.76 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0043  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3779  alpha/beta fold family hydrolase  23.76 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.385884  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.39 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  20.28 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  23.02 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.07 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 581 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.44 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>