More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6821 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  59.21 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  37.17 
 
 
314 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  35.38 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  35.38 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  35.38 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  33.21 
 
 
286 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  27.8 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  33.7 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  31.64 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  31.65 
 
 
302 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  31.97 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  28.52 
 
 
302 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  32.88 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  31.67 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.64 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  30.6 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.73 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
293 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.18 
 
 
461 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
302 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 
296 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
302 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
339 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
339 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
320 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  29.52 
 
 
306 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 
318 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
296 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
289 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
290 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
297 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
303 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.58 
 
 
308 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
324 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
297 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
291 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
294 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
300 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
861 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
300 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
294 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  28.67 
 
 
310 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
295 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.68 
 
 
922 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
301 aa  99  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  42.54 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
927 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 
875 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  34.93 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  39.17 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  23.92 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.96 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.76 
 
 
899 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.21 
 
 
978 aa  76.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  35.14 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  28.18 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.1 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  30.72 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  26.28 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  30.18 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.86 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  27.87 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
915 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>