More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1899 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
296 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.67 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  29.97 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  30.41 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  28.46 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  28.46 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2130  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1761  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363757  normal  0.624611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  29.49 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 
258 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.96 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  43.02 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  41.12 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  35.23 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  39.81 
 
 
272 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  35.23 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  34.23 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.93 
 
 
380 aa  59.3  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  35.56 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.23 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  39.53 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  35.23 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.18 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  41.77 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  36.76 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  36.96 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
404 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
387 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  31.54 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  27.68 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1783  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.403074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  28.12 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.8 
 
 
263 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 
265 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7224  alpha/beta hydrolase fold protein  42.5 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  22.51 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  28.47 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  43.21 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  40.2 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  43.21 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>