More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3897 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
309 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  44.13 
 
 
350 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
352 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  45.56 
 
 
320 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
256 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.65 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.78 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2425  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.55 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 
269 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.58 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  27.74 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.51 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.12 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 
393 aa  72.4  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.31 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.21 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.28 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.83 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.12 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.74 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.83 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  29.96 
 
 
2082 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.42 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.09 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  25.54 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.26 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  29.02 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.74 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.27 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.82 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.62 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25.8 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>