208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3240 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  30.4 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  27.71 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  28.83 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  23.55 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  25.09 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  27.92 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  25.55 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.77 
 
 		 370 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  24.64 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  24.38 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  23.21 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.09 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.08 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  25.97 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  23.74 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 326 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.17 
 
 		 370 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  21.15 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  24.3 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  21.83 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 		 2762 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  22.01 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  22.94 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  22.94 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 387 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  34.34 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  20.06 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  23.02 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  22.06 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  20.19 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  23.9 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  25.7 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  34.34 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  31.37 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.65 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4818  abhydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.448323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.36 
 
 		 437 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  21.22 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>