More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3504 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  100 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  47.48 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  45.42 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  46.62 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  43.68 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  46.26 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  45.52 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  42.56 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  44.09 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  42.91 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  46.4 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  40 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  40.51 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  40.14 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  31.09 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.3 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.86 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  27.03 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.44 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  26.16 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  28 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.4 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.65 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  30.04 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.86 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  29.48 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.44 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.78 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  26.18 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>