More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1832 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  100 
 
 
302 aa  577  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  75.52 
 
 
299 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  75.96 
 
 
301 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  75.53 
 
 
309 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  65.42 
 
 
293 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  55.86 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  55.75 
 
 
296 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  54.04 
 
 
295 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  54.79 
 
 
327 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 
304 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  54.24 
 
 
301 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  53.08 
 
 
330 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  51.02 
 
 
338 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  51.17 
 
 
384 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  54.48 
 
 
322 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  49.16 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  47.7 
 
 
303 aa  230  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  44.93 
 
 
282 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  44.09 
 
 
302 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  43.48 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 
288 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
290 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
315 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
316 aa  79  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.14 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.04 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.9 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.09 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  38.89 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.54 
 
 
639 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  40 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  37.96 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.52 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
366 aa  68.9  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  45.98 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.06 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>