More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6446 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  100 
 
 		 301 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  63.76 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  61.4 
 
 		 295 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  61.09 
 
 		 296 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  60.07 
 
 		 304 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  57.24 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  56.21 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  56.7 
 
 		 384 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  56.16 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  55.17 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  56.06 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  56.46 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  54.24 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  55.21 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  55.09 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  42.49 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  43.26 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  43.77 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  36.54 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  36.54 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  36.89 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.58 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  29.25 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.28 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.79 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.82 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.56 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  28.72 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  25.93 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.62 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.83 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.62 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  26.85 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.44 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>