More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0476 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 330 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  80.25 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  65.84 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  72.11 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  57.14 
 
 		 301 aa  301  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  55.28 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  54.74 
 
 		 295 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  55.05 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  53.08 
 
 		 302 aa  278  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  51.72 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  53.1 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  49.29 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  51.59 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  49.47 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  45.97 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  39.86 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  40.51 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  41.61 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.24 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.32 
 
 		 289 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.62 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 278 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.31 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  25.9 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  22.94 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  22.86 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  39.34 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.57 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.12 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  40.17 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>