More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0275 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  100 
 
 
288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  98.61 
 
 
288 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  85.31 
 
 
290 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  47.48 
 
 
302 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  42.7 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  43.26 
 
 
296 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 
296 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 
338 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  40.86 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  44.19 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  41.96 
 
 
322 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  47.92 
 
 
293 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  41.61 
 
 
330 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 
327 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  44.88 
 
 
301 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  40.69 
 
 
384 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  41.01 
 
 
304 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  44.52 
 
 
299 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  45.58 
 
 
309 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 
303 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  43.48 
 
 
302 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  39.79 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.19 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.76 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.5 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  37 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  30.18 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  36 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  36 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  36 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.72 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.77 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.88 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.02 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
344 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  41.18 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
421 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  35.2 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
366 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.43 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>