More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1972 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.56 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  48.39 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  43.52 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  40.68 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.43 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  43.75 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  29.07 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
371 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  42.71 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.84 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.21 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.17 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  26.97 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.39 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  29.48 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  41.28 
 
 
229 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  42.73 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  40.2 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  34.93 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  37.9 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.03 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  36.21 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>