More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3767 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  86.82 
 
 		 296 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  80.07 
 
 		 295 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  72.54 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  63 
 
 		 301 aa  341  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  57.39 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  57.5 
 
 		 299 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  57.5 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  60.35 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  55.86 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  55.28 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  56.79 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  53.18 
 
 		 384 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  51.03 
 
 		 310 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  55.09 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  43.01 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  41.94 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  42.27 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  37.04 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  26.5 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.64 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  36.11 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  38.52 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  36.11 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.19 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.74 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.27 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.56 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  26.6 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  27.9 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.28 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.21 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.54 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.53 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>