More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2631 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
268 aa  544  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  68.7 
 
 
288 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  67.68 
 
 
266 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  67.68 
 
 
266 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  67.68 
 
 
266 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  65.66 
 
 
272 aa  348  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  62.21 
 
 
263 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  63.26 
 
 
266 aa  344  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  64.89 
 
 
264 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 
267 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  60.31 
 
 
268 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  57.25 
 
 
267 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  59.92 
 
 
263 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  56.49 
 
 
267 aa  311  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  56.49 
 
 
276 aa  301  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  54.34 
 
 
267 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  53.44 
 
 
274 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  50.38 
 
 
269 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 
274 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  48.68 
 
 
273 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  48.5 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
270 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  268  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 
268 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  49.04 
 
 
281 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  45.31 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
287 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  49.61 
 
 
282 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  43.67 
 
 
268 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
270 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.09 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  27.17 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  28.26 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  27.13 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.35 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.9 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
345 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.19 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  27.38 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 
462 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  28.89 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  25.86 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  29.66 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.78 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.17 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  24.03 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  27.48 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.02 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  26.69 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  23.37 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>