More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8642 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 
321 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  45.53 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
346 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
339 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.24 
 
 
275 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
287 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.96 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
286 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
295 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
275 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.59 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
251 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
272 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.93 
 
 
462 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
265 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.43 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 
453 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
246 aa  86.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  30.93 
 
 
462 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.57 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.57 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.31 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.6 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.6 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.12 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  32.62 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  30.74 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  31.33 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.41 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  30.34 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  30.34 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  31.66 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  31.11 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.57 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>