More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0558 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 338 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  66.87 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  65.84 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  71.28 
 
 		 322 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  59.17 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  57.69 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  58.33 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  57.39 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  57.88 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  54.06 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  51.79 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  53.71 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  51.02 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  54.77 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  52.07 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  48.51 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  47.72 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  42.24 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  40.49 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  40.22 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  31.43 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.86 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.79 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.43 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.79 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 287 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  27.65 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  27.18 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.64 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.72 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.57 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 266 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  40.17 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  36.89 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.3 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>