More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1020 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  85.31 
 
 
288 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  84.97 
 
 
288 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  47.37 
 
 
302 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  43.43 
 
 
282 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 
296 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  42.12 
 
 
296 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  41.49 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  46.13 
 
 
293 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  41.95 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  41.61 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  38.69 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  38.87 
 
 
322 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  42.76 
 
 
301 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  42.4 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  42.03 
 
 
302 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  42.61 
 
 
309 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
303 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
310 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  27.97 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.99 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  35.64 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  34.65 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  34.65 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  34.65 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.88 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  26.34 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  32.41 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
504 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  22.85 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
474 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.14 
 
 
639 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.57 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.75 
 
 
257 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.08 
 
 
255 aa  62.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.27 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.87 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.14 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>