More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1698 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  100 
 
 
295 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  81.08 
 
 
296 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  80.07 
 
 
296 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  73.63 
 
 
304 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  61.4 
 
 
301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  57.69 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  59.3 
 
 
322 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  54.7 
 
 
301 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  54.9 
 
 
299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  54.39 
 
 
327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  54.74 
 
 
330 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  54.04 
 
 
302 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  52.04 
 
 
384 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  53.74 
 
 
293 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  54.12 
 
 
309 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  47.64 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 
303 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  42.56 
 
 
302 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  39.93 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  40.86 
 
 
288 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
288 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  37.96 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  37.04 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  37.04 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.92 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  36.11 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  37.04 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  42.42 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  26.04 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.57 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.94 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  41.58 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.45 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.89 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.11 
 
 
639 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.07 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  26.15 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.87 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.3 
 
 
602 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  27.08 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>