More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1095 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  76.41 
 
 		 301 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  73.21 
 
 		 298 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  70.53 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  67.15 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  58.25 
 
 		 295 aa  358  4e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  52.71 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.53 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  30.21 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.88 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.86 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.7 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.54 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 390 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 340 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.55 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 453 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 405 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.99 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 371 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.21 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  29.82 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  25.67 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 329 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.66 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.12 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.11 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.36 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.73 
 
 		 456 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 276 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 342 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>