More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3235 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 316 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.19 
 
 		 295 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  30.07 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.24 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.68 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.32 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.09 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 		 253 aa  95.9  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  27.06 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.28 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.09 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 275 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.22 
 
 		 370 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.2 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 254 aa  92.8  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 270 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 246 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 265 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.03 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  24.38 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>