More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1124 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  100 
 
 
292 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
285 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
281 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
281 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
281 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5305  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5394  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.117784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5684  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.97 
 
 
287 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5859  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
274 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
289 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3236  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
280 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21765  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4132  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
280 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
285 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0857  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.71 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00184237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  29.06 
 
 
276 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
275 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.33 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
316 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.16 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  24.9 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.77 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  25.93 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.64 
 
 
462 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  20.3 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.34 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  23.4 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  23.13 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.72 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  25.98 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  26.26 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  26.26 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.72 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  21.2 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 
350 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  24.45 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>