More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1801 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  73.81 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  67.98 
 
 
253 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  54.51 
 
 
254 aa  284  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  54.47 
 
 
255 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  49.59 
 
 
257 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  48.02 
 
 
252 aa  259  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  47.41 
 
 
257 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  46.22 
 
 
258 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  42.45 
 
 
263 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 
234 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.04 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 
277 aa  98.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
277 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
287 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
316 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.85 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.49 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  26.77 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.69 
 
 
291 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
302 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
289 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.43 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  23.9 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
295 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.29 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.29 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.29 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  29.02 
 
 
571 aa  82.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
288 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.29 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.71 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.61 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.89 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.64 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  23.93 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
291 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.92 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.91 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.91 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.44 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.05 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.91 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.05 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  23.79 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>