More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0981 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  59.2 
 
 
253 aa  323  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  55.2 
 
 
257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  54.32 
 
 
257 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  55.56 
 
 
255 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 
254 aa  284  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  53.01 
 
 
254 aa  284  8e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  273  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  47.54 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  45.42 
 
 
263 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  51.29 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
281 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
296 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.85 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.2 
 
 
372 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.38 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
291 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
299 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
372 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.69 
 
 
371 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
290 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
345 aa  89  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
339 aa  88.6  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
285 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
290 aa  89  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
285 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
283 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
285 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
315 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
289 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.95 
 
 
288 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
339 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.37 
 
 
315 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.37 
 
 
315 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  23.94 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
329 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.31 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
288 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
323 aa  82  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
290 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  22.56 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.3 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.15 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.68 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  29.05 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.24 
 
 
369 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.76 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.76 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
314 aa  79  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  23.46 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.46 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  28.22 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
293 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>