More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1047 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  58.17 
 
 
253 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  56.18 
 
 
257 aa  300  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  56.68 
 
 
257 aa  298  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  55.56 
 
 
254 aa  295  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  52.59 
 
 
258 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  53.54 
 
 
254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  54.47 
 
 
254 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  49.39 
 
 
252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  44.17 
 
 
263 aa  228  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
285 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  45.73 
 
 
234 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
339 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  28.19 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.99 
 
 
380 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.3 
 
 
371 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
288 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.1 
 
 
372 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.4 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
302 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.8 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
345 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.8 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.13 
 
 
315 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.03 
 
 
369 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.13 
 
 
315 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.8 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  26.72 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  24.04 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.25 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.4 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.15 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.15 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.15 
 
 
288 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
288 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.15 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.15 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.15 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.02 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.76 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>