More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2898 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  87.02 
 
 
290 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  81.32 
 
 
285 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  80.95 
 
 
285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  80.95 
 
 
285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  69.5 
 
 
289 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  63.86 
 
 
285 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 
295 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  43.54 
 
 
294 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  45.72 
 
 
291 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  43.99 
 
 
289 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 
298 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
283 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
284 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
286 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
279 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  39.93 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
288 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
288 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.69 
 
 
288 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
287 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
277 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
289 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
283 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  35.29 
 
 
289 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
293 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.93 
 
 
288 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.93 
 
 
288 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 
288 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
287 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.93 
 
 
293 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.93 
 
 
293 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.93 
 
 
293 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  34.93 
 
 
293 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  37.22 
 
 
271 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  33.22 
 
 
279 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
274 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  34.57 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 
273 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 
283 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
283 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
289 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.83 
 
 
282 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
283 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
276 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 
278 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.95 
 
 
291 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
291 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
278 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
282 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
286 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
271 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
278 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
296 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
281 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
293 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
290 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
297 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
283 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.36 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  25.75 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
302 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
275 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
267 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.16 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>