More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1811 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  100 
 
 		 263 aa  544  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  48.19 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  48.03 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  46.56 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  44.17 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  43.03 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  45.65 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  42.52 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  46.52 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 285 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.02 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.08 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  28.78 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  27.73 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 314 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  27.13 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 302 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.46 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 283 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 279 aa  89  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 311 aa  89  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 301 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.85 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.69 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.05 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  26.05 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.05 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.05 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.05 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.05 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 		 368 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.73 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.29 
 
 		 372 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 		 368 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 329 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  26.67 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.29 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>