More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3406 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  64.98 
 
 
257 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  66.14 
 
 
258 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  61.69 
 
 
252 aa  334  7e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  54.32 
 
 
254 aa  299  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  56.68 
 
 
255 aa  298  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  49.4 
 
 
253 aa  274  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  50.2 
 
 
254 aa  265  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  48.03 
 
 
263 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  47.41 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  52.42 
 
 
234 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  43.43 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
296 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
284 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
339 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
290 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 
371 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
340 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
339 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
340 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
308 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
370 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  21.38 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  21.38 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
345 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.88 
 
 
370 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.38 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.58 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.85 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.85 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.67 
 
 
368 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.67 
 
 
368 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.58 
 
 
372 aa  82  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.06 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  21.69 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.5 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.09 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
346 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.7 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.82 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.95 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  22.64 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  24.41 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.23 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.88 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  25.65 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>